黑龍江大學(xué)是全國高校中最早開設(shè)思想政治理論課，對大學(xué)生進(jìn)行系統(tǒng)的馬克思主義理論教育的學(xué)校之一。早在1950年哈爾濱外國語?？茖W(xué)校時(shí)期，就設(shè)立了馬克思主義理論教研室，對大學(xué)生進(jìn)行系統(tǒng)的馬克思主義理論教育。

1958年黑龍江大學(xué)成立時(shí)，在原馬克思主義理論教研室的基礎(chǔ)上成立了黑龍江大學(xué)哲學(xué)系，全校的馬克思主義理論課教學(xué)工作由哲學(xué)系承擔(dān)（其中1964年、1972年曾兩次從哲學(xué)系中分離出馬列教研室，作為學(xué)校黨委支屬的獨(dú)立機(jī)構(gòu)），這種情況一直持續(xù)到文革結(jié)束。文革后馬列主義教研室從哲學(xué)系分離出來，成為單獨(dú)的教學(xué)機(jī)構(gòu)。

1979年9月，校黨委批準(zhǔn)成立馬列教研部，下設(shè)4個(gè)教研部，負(fù)責(zé)全校思想政治理論課教學(xué)工作。

2006年12月，黑龍江大學(xué)在原馬列教研部的基礎(chǔ)上，通過整合哲學(xué)、歷史學(xué)、經(jīng)濟(jì)學(xué)等相關(guān)學(xué)科的資源，成立馬克思主義學(xué)院。馬克思主義學(xué)院下設(shè)馬克思主義基本原理教研部、思想政治教育教研部、馬克思主義中國化研究教研部、國際關(guān)系教研部、中國近現(xiàn)代史綱要教研部等5個(gè)教研部。

2010年學(xué)校將“形勢與政策”課程的教學(xué)工作劃入馬克思主義學(xué)院后，馬克思主義學(xué)院將原來的國際關(guān)系與中國近現(xiàn)代史教研部分開，設(shè)立了中國近現(xiàn)代史綱要教研部和國際關(guān)系教研部。同時(shí)學(xué)院還設(shè)有黑龍江省“兩課”教師和政工干部培訓(xùn)中心。

2015年9月我院成立“習(xí)近平系列重要講話精神教研部”。

2017年11月在“習(xí)近平系列重要講話精神教研部”的基礎(chǔ)上成立了“習(xí)近平新時(shí)代中國特色社會(huì)主義思想教研部”

2017年11月15日，經(jīng)學(xué)校同意，我院又成立了：習(xí)近平新時(shí)代中國特色社會(huì)主義思想研究院。

2017年獲批馬克思理論一級學(xué)科

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